Александровская барачная больница была основана в 1882 году (17 апреля 1882 г.). С 1891 года больнице было присвоено имя Сергея Петровича Боткина (Александровкая барачная больница в память С.П. Боткина). Мощность больницы при открытии составляла 300 коек, однако больница постоянно расширялась и к 1915 году коечный фонд составлял 700 коек. Больничная аптека помимо нужд стационара обеспечивала медикаментами всех думских врачей города, ряд родильных приютов, санитарных и школьных врачей города. Переломный момент в истории стационара наступил в 1922 году, когда главным врачом больницы был назначен Глеб Александрович Ивашенцов. В больницу были привлечены новые врачебные кадры, медицинский и обслуживающий персонал, развернулись ремонтно-восстановительные работы и уже к осени 1924 больница работала на полную мощность. Коечный фонд больницы достиг 720, а вскоре – 800 коек. В период 1927 – 1939 гг. было сооружено 11 крупных каменных больничных корпусов, отвечавших всем необходимым требованиям. Мощность больницы увеличилась до 1230 коек, из которых только 515 размещались в деревянных, но капитально отремонтированных бараках. В период Великой Отечественной Войны и 900-дневной блокады Ленинграда объём работы значительно увеличился. Работа велась штатным составом, заполненным на треть, в условиях голода, недостатка медикаментов, обстрелов и бомбежек, при перебоях в снабжении водой и электроэнергией. На фоне глубокой алиментарной дистрофии резко изменилось течение ряда инфекционных заболеваний, значительно возросла больничная летальность. В послевоенное время в 1966 г. было принято решение о коренной реконструкции больницы (главный врач Стуков В.В.). Проектная коечная мощность больницы была определена в 1600 коек. Было построено 3 крупных лечебных корпуса на 828 коек. С 1972 г. в больнице работает один из первых в стране блоков интенсивной терапии инфекционных больных. Свое 120-летие (2002 г.) больница встречала как крупнейший в стране инфекционный стационар на 1210 коек, принимавший на лечение ежегодно до 35 тысяч больных.